祖母绿和翡翠属于两种完全不同的宝玉石产品，确实具有本质的区别：
首先，祖母绿是一种宝石，是含铍铝的硅酸盐，其分子式为Be3Al2[Si6O18]，属于绿柱石家族中最“高贵”的一员；而翡翠是一种玉石，主要组成物为硅酸铝钠NaAl9(Si2O6)。化学构成就决然不同。
第二，祖母绿属于宝石，硬度比翡翠更高；不过翡翠的密度更大，比祖母绿更压手。两者的各种物理、化学性状都有较大的差异。
第三，翡翠是唯一在缅甸出产的玉石，形成的地质原因非常特殊；祖母绿虽然也很珍贵，但全世界很多地方都有出产。不过由于祖母绿的历史更悠久，在国际宝玉石行业祖母绿的平均价位比翡翠还要略高。
第四，祖母绿是绿柱石中的一个品种，颜色为绿色；祖母绿的颜色很经典，祖母绿有时候也被称为这种颜色的名称。翡翠中也有如同祖母绿一般的颜色，有时候人们会说这是一块祖母绿的翡翠，就是指这块翡翠的颜色是祖母绿一般的绿色，即使如此，两者也是有很大差异的。何况翡翠除了绿色，还有紫罗兰、黄红黑白等颜色。