翡翠上有黑点通常是自然形成的矿物晶体状态，是自然现象。翡翠是由以硬玉为主的无数细小纤维状矿物微晶纵横交织而形成的致密块状集合体，主要组成物为硅酸铝钠NaAl9(Si2O6)，宝石矿中含有超过50%以上的硅酸铝钠才被视为翡翠)，往往伴生在蓝闪石、白云母、硬柱石（二水钙长石）、霰石和石英。
通常翡翠上的黑点有几种可能是：
（1）极端浓郁的绿色，也就是墨色，形成的墨点，强光照射下墨点会显现绿色特征；
（2）其它半生矿物，例如褐色云母、霰石等；
（3）部分深色矿物元素富集而成，例如氧化铁、氧化铜、锰元素等富集造成的黑点。
总之，只要是A货翡翠，上面的黑点通常是翡翠形成过程中，地质演变导致的矿物元素富集、伴生矿等自然分布的特征，属于很自然的现象。如果是一般绿色翡翠，那么黑点的存在势必会影响翡翠整体外观，价值上也会有所影响。如果在无色或白色为主体的翡翠制品中含有暗色的矿物，对翡翠的外观不产生负面的影响，反而会提高翡翠制品的价值，这时这些暗色的色带不当作净度特征，而是作为颜色要素来看待。

而且有黑点的翡翠材料，种份老，这里的“种份老”，除了质地致密细腻、“水头足”之外，最主要的就是绿色浓艳。也就是说，老种绿色的翡翠最容易出现黑点，但往往绿色浓艳的翡翠能把黑点掩饰，黑点较为细小而不易被发现。因此，当发现翡翠上有黑点时，先别着急，也许它是珍贵的老坑种翡翠。