洪水后疫情可能在自然灾害饥饿、饮用水短缺等导致人体免疫力下降、生化污染、灾后自然环境剧变导致环境微生态变化、受灾群众聚集环境、专业医疗支持力度、资源短缺等多方面引起疫情和传染病大面积爆发。

洪水后的扑杀处置非常重要，只有这样才能最大限度地减少灾后传染病的发生和传播。 我们不仅要积极应对洪涝灾害的原生灾害，还要预防洪水后传染病的发生。 洪水后疫情可能在自然灾害饥饿、饮用水短缺等导致人体免疫力下降、生化污染、灾后自然环境剧变导致环境微生态变化、受灾群众聚集环境、专业医疗支持力度、资源短缺等多方面引起疫情和传染病大面积爆发。

生化污染是指生化污染，通俗地说，就是动物尸体腐烂后产生的有毒有害气体、液体的渗透、扩散对灾区卫生状况的极坏影响。 生物腐烂后产生的气体、液体，在携带大量有毒物质的同时，革兰氏菌、孢霉等致死性极强的细菌有数量及其巨大的病原菌。 尸体液化后，有毒物质和大量病菌随尸体水渗入地下水层或扩散到空气物种中，污染水源和灾区大气。 同时，尸体腐烂时招致的苍蝇等生物，也带着大量的病原菌到处传播。

而且，受灾者通常自发地或有组织地聚集在比较安全的区域生活或等待救助。 这个比较安全的区域因为各种各样的理由，其面积狭小，人口密度极高，卫生条件极差。 大多数情况下，受灾者在灾后心理和体力上是双重透明的。 物资有限，灾民的饮食、保温、休息等得不到保障，老鼠、蟑螂等四害也在灾民聚集的地方泛滥，牲畜、宠物缺乏监管，徘徊、吃喝，成为积极的致病源，为传播疾病提供有利条件

洪水过后，往往引起各种疾病的传播和流行。 这些常见病是伤寒、肝炎、霍乱、痢疾、感染性腹泻等肠道传染病疟疾、乙型脑炎等因蚊虫叮咬传播的疾病； 流行性出血热、钩端螺旋体病； 因吃霉变食物引起的食物中毒； 与患病家畜如牛、马、羊、猪的接触机会增加，有可能传播给人； 长江中下游血吸虫流行区洪水时钉螺面积扩大，接触阳性螺区疫水，易发生血吸虫病急性感染。